Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Apobec2Q9WV35 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Apobec2Q9WV35 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms