Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP1

Ramp3, Receptor activity-modifying protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ramp3Q9WUP1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ramp3Q9WUP1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ramp3Q9WUP1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms