Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Opn3Q9WUK7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms