Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stub1Q9WUD1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stub1Q9WUD1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms