Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pus1Q9WU56 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Pus1Q9WU56 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pus1Q9WU56 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms