Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pfdn5Q9WU28 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pfdn5Q9WU28 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pfdn5Q9WU28 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pfdn5Q9WU28 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pfdn5Q9WU28 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pfdn5Q9WU28 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms