Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ptpn4Q9WU22 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn4Q9WU22 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms