Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Skp1Q9WTX5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms