Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp18Q9WTV6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp18Q9WTV6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms