Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcc6Q9R1S7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcc6Q9R1S7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Abcc6Q9R1S7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abcc6Q9R1S7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abcc6Q9R1S7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abcc6Q9R1S7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abcc6Q9R1S7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abcc6Q9R1S7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abcc6Q9R1S7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abcc6Q9R1S7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abcc6Q9R1S7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abcc6Q9R1S7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abcc6Q9R1S7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Abcc6Q9R1S7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Abcc6Q9R1S7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Abcc6Q9R1S7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms