Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tubd1Q9R1K7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tubd1Q9R1K7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms