Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trex2Q9R1A9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms