Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NrkQ9R0G8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NrkQ9R0G8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NrkQ9R0G8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NrkQ9R0G8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NrkQ9R0G8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NrkQ9R0G8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NrkQ9R0G8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NrkQ9R0G8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NrkQ9R0G8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NrkQ9R0G8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NrkQ9R0G8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NrkQ9R0G8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NrkQ9R0G8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NrkQ9R0G8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NrkQ9R0G8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NrkQ9R0G8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NrkQ9R0G8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NrkQ9R0G8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NrkQ9R0G8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NrkQ9R0G8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NrkQ9R0G8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NrkQ9R0G8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NrkQ9R0G8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms