Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Nek3Q9R0A5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nek3Q9R0A5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms