Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AmfrQ9R049 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AmfrQ9R049 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms