Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp21Q9QZL6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp21Q9QZL6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms