Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYL7

Abt1, Activator of basal transcription 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abt1Q9QYL7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abt1Q9QYL7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Abt1Q9QYL7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Abt1Q9QYL7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abt1Q9QYL7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abt1Q9QYL7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abt1Q9QYL7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abt1Q9QYL7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abt1Q9QYL7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abt1Q9QYL7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abt1Q9QYL7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms