Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYL0

Hils1, Spermatid-specific linker histone H1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hils1Q9QYL0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hils1Q9QYL0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hils1Q9QYL0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hils1Q9QYL0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hils1Q9QYL0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hils1Q9QYL0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hils1Q9QYL0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hils1Q9QYL0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hils1Q9QYL0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hils1Q9QYL0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hils1Q9QYL0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hils1Q9QYL0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hils1Q9QYL0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hils1Q9QYL0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hils1Q9QYL0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hils1Q9QYL0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hils1Q9QYL0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hils1Q9QYL0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hils1Q9QYL0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hils1Q9QYL0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hils1Q9QYL0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hils1Q9QYL0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hils1Q9QYL0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms