Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tspan3Q9QY33 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tspan3Q9QY33 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms