Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cbx8Q9QXV1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cbx8Q9QXV1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cbx8Q9QXV1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cbx8Q9QXV1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cbx8Q9QXV1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cbx8Q9QXV1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cbx8Q9QXV1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms