Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ChmQ9QXG2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms