Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim44Q9QXA7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Trim44Q9QXA7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
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