Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Krt17Q9QWL7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Krt17Q9QWL7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms