Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUP5

Hapln1, Hyaluronan and proteoglycan link protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln1Q9QUP5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hapln1Q9QUP5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hapln1Q9QUP5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms