Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr4Q9QUK6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tlr4Q9QUK6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms