Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sfmbt1Q9JMD1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms