Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gkap1Q9JMB0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms