Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prg4Q9JM99 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg4Q9JM99 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg4Q9JM99 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg4Q9JM99 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg4Q9JM99 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg4Q9JM99 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg4Q9JM99 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg4Q9JM99 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg4Q9JM99 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg4Q9JM99 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg4Q9JM99 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg4Q9JM99 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg4Q9JM99 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg4Q9JM99 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg4Q9JM99 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg4Q9JM99 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg4Q9JM99 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg4Q9JM99 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prg4Q9JM99 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms