Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM93

Arl6ip4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip4Q9JM93 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl6ip4Q9JM93 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arl6ip4Q9JM93 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms