Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SrfQ9JM73 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrfQ9JM73 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms