Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Crlf1Q9JM58 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Crlf1Q9JM58 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Crlf1Q9JM58 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Crlf1Q9JM58 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Crlf1Q9JM58 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Crlf1Q9JM58 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Crlf1Q9JM58 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Crlf1Q9JM58 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Crlf1Q9JM58 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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