Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LitafQ9JLJ0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms