Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Tgm1Q9JLF6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Tgm1Q9JLF6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tgm1Q9JLF6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms