Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gde1Q9JL56 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gde1Q9JL56 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms