Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scamp4Q9JKV5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scamp4Q9JKV5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms