Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pole3Q9JKP7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pole3Q9JKP7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms