Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
AtrQ9JKK8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms