Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trem1Q9JKE2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trem1Q9JKE2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms