Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ybx3Q9JKB3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ybx3Q9JKB3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ybx3Q9JKB3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms