Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
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Uchl3Q9JKB1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Uchl3Q9JKB1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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Uchl3Q9JKB1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Uchl3Q9JKB1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Uchl3Q9JKB1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Uchl3Q9JKB1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Uchl3Q9JKB1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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Uchl3Q9JKB1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Uchl3Q9JKB1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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Uchl3Q9JKB1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uchl3Q9JKB1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uchl3Q9JKB1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uchl3Q9JKB1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uchl3Q9JKB1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Uchl3Q9JKB1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uchl3Q9JKB1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uchl3Q9JKB1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uchl3Q9JKB1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Uchl3Q9JKB1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uchl3Q9JKB1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uchl3Q9JKB1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uchl3Q9JKB1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uchl3Q9JKB1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uchl3Q9JKB1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uchl3Q9JKB1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uchl3Q9JKB1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uchl3Q9JKB1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uchl3Q9JKB1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uchl3Q9JKB1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uchl3Q9JKB1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uchl3Q9JKB1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Uchl3Q9JKB1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Uchl3Q9JKB1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Uchl3Q9JKB1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uchl3Q9JKB1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Uchl3Q9JKB1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms