Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Msgn1Q9JK54 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Msgn1Q9JK54 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms