Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alyref2Q9JJW6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms