Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efcc1Q9JJF6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Efcc1Q9JJF6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms