Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc12a4Q9JIS8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms