Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp1r3fQ9JIG4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp1r3fQ9JIG4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms