Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copb1Q9JIF7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Copb1Q9JIF7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms