Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tcirg1Q9JHF5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tcirg1Q9JHF5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms