Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn12Q9ET43 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn12Q9ET43 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms