Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem27Q9ESG4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tmem27Q9ESG4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms