Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trhr2Q9ERT2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trhr2Q9ERT2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trhr2Q9ERT2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trhr2Q9ERT2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trhr2Q9ERT2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trhr2Q9ERT2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trhr2Q9ERT2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trhr2Q9ERT2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trhr2Q9ERT2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trhr2Q9ERT2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms